李园园 博士,研究员
中心生物医学转化平台主任
系统生物学研究组课题组长。
上海生物医学研究院生物医学转化应用中心副主任
上海药物转化工程技术研究中心执行主任。
细胞周期相关的真核基因转录调控
1996年本科毕业于南开大学微生物系
1999年硕士毕业于中国医学科学院协和医科大学肿瘤研究所分子病毒学实验室
2003年博士毕业于中科院上海生化所。
在PLoS Computational Biology、Bioinformatics、Molecular Systems Biology等专业期刊上发表论文30余篇,其中第一作者6篇,通讯作者19篇,总影响因子超过120,第一作者及通讯作者单篇最高他引次数超过60。获软件著作权6项,发明专利授权1项。目前主要负责公司PDX平台建设。
2006年上海市科技启明星。
2013年明治科学奖。
1.Yang J, Li YY, Li YX, Ye ZQ. Partition dataset according to amino acid type improves the prediction of deleterious non-synonymous SNPs. BBRC. 2012; 419(1):99-103
2.Hu SN, Yu H, Zhang YB, Wu ZL, Yan YC, Li YX, Li YY, Li YP. Splice blocking of zygotic sox31 leads to developmental arrest shortly after Mid-Blastula Transition and induces apoptosis in zebrafish. FEBS letters. 2012 Feb 3; 586(3):222-8.
3.Chang X, Li Y, Ping J, Xing XB, Sun H, Jia P, Wang C, Li YY*, Li YX*. EcoBrowser: a web-based tool for visualizing transcriptome data of Escherichia coli. BMC Research Notes. 2011 Oct 13; 4:405.
4.Yu H, Liu BH, Ye ZQ, Li C, Li YX*, Li YY*. Link-based quantitative methods to identify differentially co-expressed genes and gene pairs. BMC Bioinformatics.2011; 12:315.
5.Li RD, Li YY, Lu LY, Ren C, Li YX, Liu L*. An improved kinetic model for the acetone-butanol-ethanol pathway of Clostridium acetobutylicum and model-based perturbation analysis. BMC Syst Biol. 2011 Jun 20; 5 Suppl 1:S12.