孙红 生物物理学博士,研究员
上海市儿童医院研究员
生物信息学、基因工程、生物与医药、基因组学、遗传学、系统生物学。
2009年,主持上海自然科学基金项目,miRNA分析平台及调控机制研究。
2014年,主持国家自然科学基金面上项目,正反义转录机制和调控网络的系统研究
2016年,主持上海交大医工交叉项目,基于组学特征谱的新型遗传性疾病诊断工具。
2009年,参与国家国家重点基础研究发展计划(973计划)项目,基于系统生物医学基础的白血病临床转化研究。
2010年,参与国家国家重点基础研究发展计划(973计划)项目,表观遗传变异在肺癌发生发展中的作用和机制。
在国际刊物上已发表16篇SCI论文,包括Genome Research,Hum Mol Genet, BMC Genomics, Scientific Reports, Oncotarget, BMC Bioinformatics, Journal of Genetics and Genomics等。
1. Ning Q, Li Y, Wang Z, Zhou S, Sun H, Yu G. The Evolution and Expression Pattern of Human Overlapping lncRNA and Protein-coding Gene Pairs. Scientific Reports. 2017; 7:42775.
2. Yang S, Ning Q, Zhang G, Sun H, Wang Z, Li Y. Construction of differential mRNA-lncRNA crosstalk networks based on ceRNA hypothesis uncover key roles of lncRNAs implicated in esophageal squamous cell carcinoma. Oncotarget. 2016; 7(52).
3. Wang Y, Li R, Ji C, Shi S, Cheng Y, Sun H, Li Y. Quantitative dynamic modelling of the gene regulatory network controlling adipogenesis. PLOS ONE. 2014; 9(10):e110563.
4. Zhu Y, Skogerbø G, Ning Q, Wang Z, Li B, Yang S, Sun H, Li Y. Evolutionary relationships between miRNA genes and their activity. BMC Genomics. 2012; 13(1):718.
5. Wang Y, Zhou Y, Li Y, Ling Z, Zhu Y, Guo X, Sun H. An improved dimensionality reduction method for meta-transcriptome indexing based diseases classification. BMC Systems Biology. 2012; 6(Suppl 3):S12.
6. Sun H, Yang S, Tun L, Li Y. IAOseq: inferring abundance of overlapping genes using RNA-seq data.BMC Bioinformatics. 2015; 16(Suppl 1):S3.
7. Sun H, Chen HF, Chen R. Genome Comparisons as a Tool for Antimicrobial Target Discovery. Methods Mol Biol. 2013; 993:31-8.